1.资金配套不到位 　　提供人员、方法时未提供相应配套资金，导致6S精益管理中的有些项目难以开展。例如定位管理中需要所有生产现场、办公区域、仓库、食堂内应有定置图，而且定置图应为彩色打印，装于铝合金框内悬挂起来。形迹管理需要使用油漆或不干胶条对管道、通道、作业区域标识。不统一的桌椅、电脑需要更换。这些都需要对应的资金，如果集团公司不提供配套资金，二级单位就会从员工奖金中扣除部分后用于6S精益管理，这会引起部分员工对6S精益管理的抵制和不满。 2.前承后继的衔接问题 　　在很多的老企业中，员工是否认为如今的6S精益管理是现场管理的“高级版”？现在设备定置管理如何与当时设备的对接？6S精益管理推进办公室制订的推进方案要求电脑、桌椅型号相同，为此各单位花费巨资淘汰不同型号的办公用品，但是产品在不断变化，如果此种型号不再生产，如何保证5年后的6S精益管理时产品型号相同呢？ 3.制度标准不完善 　　6S精益管理的制度标准不明确，其中人为因素过重，不同员工对规则理解不同。形迹管理法规定在地面上用彩色或油漆标识运动物体的轨迹，具体表现在门上时：正常情况下应标识向外开门的形迹而非是向内开门的形迹。但是有的二级单位理解为所有门的运动形迹均需标识，导致在公司检查验收后，员工耗用大量时间刮除所有标识的向内开门的形迹。还有，公司规定生产现场垃圾分为工业垃圾和生活垃圾，工业垃圾用黄色垃圾桶，生活垃圾用蓝色或红色垃圾桶。厂区和办公区域垃圾分为可回收垃圾和不可回收垃圾，可回收垃圾用绿色垃圾桶，不可回收垃圾用黄色垃圾桶。根据以上规定，员工喝完瓶装水后，扔在工作现场时，应扔到蓝色或红色垃圾桶中，如果扔在办公室内，则应扔到绿色垃圾桶中，因而人为增加诸多不方便。 4.定位管理形式与内容的关系不符 　　定位管理到底是否为形式上的绝对定位，即采用不干胶或颜色在物品放置区域投射出物品形状。在实际操作中，定位管理强调过重，有些近乎荒唐，甚至影响空间美观。正确的做法是，在办公室整顿中，将打印机、电脑桌、复印机摆放至彩色区域线内；会议室里则对所有设施包括桌、椅、电话、烟灰缸、投影机、白板、白板笔、笔擦、茶杯全部定位，均摆放于相应区域线内；6S精益管理推行手册要求员工设法对抽屉内物品定位，以便于取放。